优良菌种的质量标准主要是纯、壮两条：第一要纯，就是各种栽培食用菌种菌丝体内不得混入杂菌和其他菌种，不得混有毛霉、曲霉、木霉、绿霉等任何霉菌或细菌、病毒等，例如平菇不得混入其他食用菌丝体。第二要壮，菌种长相正常，长势旺，再生能力强，吃料发菌快，杂菌不易污染，一般菌种培养25天即可完全吃料，如果说超过时间太长，表示菌种已经老化，就不宜作菌种。
 

    食用菌菌种是菌丝体的纯养物，农民在生产中购买的试管母种不能直接栽培，必须扩大培养成原种，由原种再扩繁为栽培种后，才能在生产上广泛利用，一般从菌种场或科研单位购买的母种多已转管2-3次，菌种场或菇农转管一次比较稳妥，省级菌种场要求出售转管一次的母种即原始母种，如果县、乡及农民将菌种转管次数过多就会出现菌丝生长缓慢，出菇推迟，菇形小，质量差，甚至出现不出菇的现象，通常称这些现象叫菌种退化。国家农业部规定，食用菌种一二级即母种的原种主要由国家办的菌种场、院来生产，县乡菌种场主要生产三级菌种供广大菇农栽培种的需要。

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